Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spp1P10923 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms