Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms