Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms