Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pla2g4bP0C871 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms