Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefmP08553 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefmP08553 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NefmP08553 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NefmP08553 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefmP08553 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefmP08553 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms