Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MybP06876 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MybP06876 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MybP06876 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MybP06876 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MybP06876 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MybP06876 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MybP06876 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MybP06876 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MybP06876 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms