Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-AaP01910 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H2-AaP01910 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H2-AaP01910 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H2-AaP01910 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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H2-AaP01910 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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