Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01666 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01666 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01666 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01666 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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