Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01661 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01661 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01661 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms