Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp8O89110 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms