Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CopeO89079 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopeO89079 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopeO89079 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms