Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms