Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms