Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms