Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt1O88346 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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