Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lnx1O70263 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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