Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms