Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs5O54928 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms