Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DffaO54786 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DffaO54786 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DffaO54786 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DffaO54786 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DffaO54786 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms