Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc4O35988 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sdc4O35988 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sdc4O35988 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sdc4O35988 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sdc4O35988 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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