Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms