Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tnfrsf18O35714 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf18O35714 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Tnfrsf18O35714 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tnfrsf18O35714 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tnfrsf18O35714 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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