Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms