Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms