Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms