Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms