Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ColqO35348 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ColqO35348 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ColqO35348 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ColqO35348 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ColqO35348 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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