Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms