Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Pkd2O35245 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pkd2O35245 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pkd2O35245 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Pkd2O35245 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Pkd2O35245 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms