Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr1aO35134 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms