Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LhbO09108 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LhbO09108 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LhbO09108 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LhbO09108 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LhbO09108 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LhbO09108 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LhbO09108 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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LhbO09108 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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LhbO09108 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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LhbO09108 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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LhbO09108 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LhbO09108 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LhbO09108 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LhbO09108 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LhbO09108 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LhbO09108 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms