Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms