Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm26700-201ENSMUST00000181480 1957 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm9060-201ENSMUST00000120926 805 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm4924-201ENSMUST00000165906 2645 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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