Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5849J3QPE5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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