Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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