Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms