Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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