Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms