Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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