Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm11236J3QMS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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