Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms