Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6594J3QM43 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6594J3QM43 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6594J3QM43 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6594J3QM43 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6594J3QM43 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms