Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn34c3J3QJW5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn34c3J3QJW5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn34c3J3QJW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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