Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20815J3KMI0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms