Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Taf4bG5E8Z2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms