Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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