Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HrcG5E8J6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HrcG5E8J6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms