Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms