Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp72F8VQC1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms