Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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